Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyrm1Q9CQB7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lyrm1Q9CQB7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lyrm1Q9CQB7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lyrm1Q9CQB7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lyrm1Q9CQB7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lyrm1Q9CQB7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lyrm1Q9CQB7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms