Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pole4Q9CQ36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole4Q9CQ36 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole4Q9CQ36 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole4Q9CQ36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole4Q9CQ36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole4Q9CQ36 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms