Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5Q9CPW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arpc5Q9CPW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc5Q9CPW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arpc5Q9CPW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5Q9CPW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arpc5Q9CPW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arpc5Q9CPW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms