Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt88Q9CPR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt88Q9CPR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt88Q9CPR6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt88Q9CPR6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt88Q9CPR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt88Q9CPR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms