Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP44Q9C0F1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP44Q9C0F1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP44Q9C0F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP44Q9C0F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP44Q9C0F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP44Q9C0F1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP44Q9C0F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP44Q9C0F1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP44Q9C0F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP44Q9C0F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP44Q9C0F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms