Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG6Q9BXT2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG6Q9BXT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG6Q9BXT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG6Q9BXT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNG6Q9BXT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms