Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1QTNF1Q9BXJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1QTNF1Q9BXJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF1Q9BXJ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1QTNF1Q9BXJ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms