Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCRT1Q9BWW7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCRT1Q9BWW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCRT1Q9BWW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCRT1Q9BWW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCRT1Q9BWW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCRT1Q9BWW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCRT1Q9BWW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCRT1Q9BWW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms