Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF4Q9BUZ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF4Q9BUZ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF4Q9BUZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF4Q9BUZ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF4Q9BUZ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF4Q9BUZ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms