Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM208Q9BTX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM208Q9BTX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM208Q9BTX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM208Q9BTX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM208Q9BTX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM208Q9BTX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM208Q9BTX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM208Q9BTX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM208Q9BTX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.4 ms