Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINS3Q9BRX5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINS3Q9BRX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GINS3Q9BRX5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms