Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC50A1Q9BRV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC50A1Q9BRV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC50A1Q9BRV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC50A1Q9BRV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC50A1Q9BRV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC50A1Q9BRV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms