Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF8Q9BRL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF8Q9BRL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF8Q9BRL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF8Q9BRL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF8Q9BRL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms