Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZSWIM1Q9BR11 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZSWIM1Q9BR11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZSWIM1Q9BR11 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSWIM1Q9BR11 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZSWIM1Q9BR11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZSWIM1Q9BR11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms