Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF4Q9BQW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF4Q9BQW3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EBF4Q9BQW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF4Q9BQW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EBF4Q9BQW3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF4Q9BQW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF4Q9BQW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF4Q9BQW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms