Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LPIN3Q9BQK8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LPIN3Q9BQK8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPIN3Q9BQK8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LPIN3Q9BQK8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LPIN3Q9BQK8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms