Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RetnQ99P87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RetnQ99P87 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RetnQ99P87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RetnQ99P87 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RetnQ99P87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms