Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NsmfQ99NF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NsmfQ99NF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NsmfQ99NF2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NsmfQ99NF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NsmfQ99NF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NsmfQ99NF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NsmfQ99NF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NsmfQ99NF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NsmfQ99NF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NsmfQ99NF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms