Protein–RNA interactions for Protein: Q99N42

Tymp, Thymidine phosphorylase, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TympQ99N42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TympQ99N42 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TympQ99N42 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TympQ99N42 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TympQ99N42 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TympQ99N42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TympQ99N42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TympQ99N42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TympQ99N42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TympQ99N42 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TympQ99N42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TympQ99N42 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TympQ99N42 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TympQ99N42 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TympQ99N42 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TympQ99N42 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TympQ99N42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TympQ99N42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TympQ99N42 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TympQ99N42 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TympQ99N42 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TympQ99N42 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TympQ99N42 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TympQ99N42 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TympQ99N42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TympQ99N42 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TympQ99N42 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TympQ99N42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TympQ99N42 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TympQ99N42 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms