Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a4dQ99N05 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ms4a4dQ99N05 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ms4a4dQ99N05 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ms4a4dQ99N05 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a4dQ99N05 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a4dQ99N05 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4dQ99N05 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms