Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rnf17Q99MV7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rnf17Q99MV7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Rnf17Q99MV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rnf17Q99MV7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Rnf17Q99MV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rnf17Q99MV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rnf17Q99MV7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rnf17Q99MV7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rnf17Q99MV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rnf17Q99MV7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rnf17Q99MV7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rnf17Q99MV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rnf17Q99MV7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rnf17Q99MV7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rnf17Q99MV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rnf17Q99MV7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms