Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm3Q99LJ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm3Q99LJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm3Q99LJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmtm3Q99LJ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm3Q99LJ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms