Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clp1Q99LI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clp1Q99LI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clp1Q99LI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clp1Q99LI9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clp1Q99LI9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clp1Q99LI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clp1Q99LI9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clp1Q99LI9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clp1Q99LI9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms