Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nmd3Q99L48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nmd3Q99L48 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nmd3Q99L48 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nmd3Q99L48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nmd3Q99L48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nmd3Q99L48 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms