Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK9

Hars2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hars2Q99KK9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hars2Q99KK9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hars2Q99KK9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hars2Q99KK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hars2Q99KK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hars2Q99KK9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hars2Q99KK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hars2Q99KK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hars2Q99KK9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hars2Q99KK9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms