Protein–RNA interactions for Protein: Q99JP6

Homer3, Homer protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer3Q99JP6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Homer3Q99JP6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Homer3Q99JP6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Homer3Q99JP6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Homer3Q99JP6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Homer3Q99JP6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Homer3Q99JP6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Homer3Q99JP6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer3Q99JP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Homer3Q99JP6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms