Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3GL3Q99963 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3GL3Q99963 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3GL3Q99963 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GL3Q99963 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms