Protein–RNA interactions for Protein: Q99929

ASCL2, Achaete-scute homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL2Q99929 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASCL2Q99929 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL2Q99929 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASCL2Q99929 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASCL2Q99929 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASCL2Q99929 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms