Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CIB1Q99828 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIB1Q99828 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIB1Q99828 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB1Q99828 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CIB1Q99828 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CIB1Q99828 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB1Q99828 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms