Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMKLR1Q99788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMKLR1Q99788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMKLR1Q99788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CMKLR1Q99788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMKLR1Q99788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMKLR1Q99788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms