Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPER1Q99527 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPER1Q99527 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPER1Q99527 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPER1Q99527 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPER1Q99527 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPER1Q99527 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPER1Q99527 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms