Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SIN3AQ96ST3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SIN3AQ96ST3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SIN3AQ96ST3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SIN3AQ96ST3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SIN3AQ96ST3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
SIN3AQ96ST3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SIN3AQ96ST3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SIN3AQ96ST3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SIN3AQ96ST3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SIN3AQ96ST3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
SIN3AQ96ST3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms