Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM209Q96SK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM209Q96SK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM209Q96SK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM209Q96SK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM209Q96SK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM209Q96SK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM209Q96SK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM209Q96SK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM209Q96SK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms