Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLCC1Q96S66 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLCC1Q96S66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCC1Q96S66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLCC1Q96S66 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms