Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBS4Q96RK4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBS4Q96RK4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS4Q96RK4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS4Q96RK4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS4Q96RK4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms