Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CITED4Q96RK1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CITED4Q96RK1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CITED4Q96RK1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITED4Q96RK1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CITED4Q96RK1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms