Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DEPDC7Q96QD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DEPDC7Q96QD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DEPDC7Q96QD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DEPDC7Q96QD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DEPDC7Q96QD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms