Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC9Q96Q05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC9Q96Q05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC9Q96Q05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC9Q96Q05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC9Q96Q05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC9Q96Q05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms