Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS2Q96PQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SORCS2Q96PQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SORCS2Q96PQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SORCS2Q96PQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORCS2Q96PQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS2Q96PQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms