Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCEEQ96PE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCEEQ96PE7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCEEQ96PE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCEEQ96PE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCEEQ96PE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCEEQ96PE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCEEQ96PE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCEEQ96PE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms