Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPRD1AQ96P16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPRD1AQ96P16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPRD1AQ96P16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPRD1AQ96P16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPRD1AQ96P16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPRD1AQ96P16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPRD1AQ96P16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms