Protein–RNA interactions for Protein: Q96NX9

DACH2, Dachshund homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DACH2Q96NX9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DACH2Q96NX9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DACH2Q96NX9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DACH2Q96NX9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DACH2Q96NX9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DACH2Q96NX9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DACH2Q96NX9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DACH2Q96NX9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DACH2Q96NX9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DACH2Q96NX9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DACH2Q96NX9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms