Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF578Q96N58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF578Q96N58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF578Q96N58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF578Q96N58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms