Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00052Q96N35 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00052Q96N35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00052Q96N35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00052Q96N35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00052Q96N35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00052Q96N35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms