Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG8Q96MW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COG8Q96MW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG8Q96MW5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG8Q96MW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG8Q96MW5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG8Q96MW5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms