Protein–RNA interactions for Protein: Q96MB7

HARBI1, Putative nuclease HARBI1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARBI1Q96MB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HARBI1Q96MB7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HARBI1Q96MB7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HARBI1Q96MB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HARBI1Q96MB7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HARBI1Q96MB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms