Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C10orf90Q96M02 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf90Q96M02 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf90Q96M02 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C10orf90Q96M02 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C10orf90Q96M02 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C10orf90Q96M02 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf90Q96M02 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf90Q96M02 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C10orf90Q96M02 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms