Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf72Q96LT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf72Q96LT7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C9orf72Q96LT7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C9orf72Q96LT7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf72Q96LT7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf72Q96LT7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9orf72Q96LT7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms