Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGLYRP3Q96LB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP3Q96LB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGLYRP3Q96LB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP3Q96LB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP3Q96LB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGLYRP3Q96LB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGLYRP3Q96LB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms