Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX4I2Q96KJ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX4I2Q96KJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX4I2Q96KJ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX4I2Q96KJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX4I2Q96KJ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX4I2Q96KJ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms